国控临床医学专业和针灸推拿专业正在申报中。学院设有基础医学、临床技能、护理技能三大实验实训中心,建筑面积21862平方米。学院第二期建设含第二教学大楼、第三实验实训大楼、图书馆等，占地面积31056.1平方米。学院有附属医院2所，教学医院2所，实习基地33个。
五年制大专招生对象为应届初中生，往届初中生可以选择就读3+3模式。
五年制大专，也称为五年高职，学制五年，是初中毕业生上大学（大专）的最快捷径、是我国高等教育重要组成部分。旨在培养出一批具有大学知识，又有一定专业技术和技能的高级技术人员，其知识的讲授是以够用为度、实用为本。在我国高等教育中，大专就业率远远高于本科就业率。五年毕业后，取得中华人民共和国教育部监制、国家承认、普通高等学校统招的大学专科文凭。毕业后学校推荐就业。
昭通卫生职业学院于2016年3月获得云南省政府批准，4月通过国家教育部备案，9月首批招生，是昭通及周边地区唯一从事医学职业教育的专科层次公办普通高等职业院校。学院由昭通市人民政府主管，业务接受省、市教体和卫健部门的指导，实行党委领导下的院长负责制，为财政全额预算公益二类事业单位。
当前，学院正不断强基固本，立德树人，狠抓特色党建引领，夯实专业人才培养，强化思政建设功能，抓实教育教学改革，确保校园安全维稳，做好就业创新创业，做实挂钩帮扶和驻村扶贫工作。学院将在市委、市政府的领导下，在市教体局的关心支持下，不忘初心，继续前进，以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入贯彻落实十九大精神，立足新时代，打造新气象，以卓有成效的卫生人才培养实践助力昭通全面脱贫攻坚和经济社会发展。
近年来，学院党政带领全校师生，开拓创新，积极进取，先后获得省级平安校园、省级毒品预防示范学校、云南省民族宗教事务委员会爱国主义民族团结进步教育系列活动优秀组织奖、全省征兵工作先进单位、全省“天堰杯”医护技能大赛团体二等奖、全省大学生高职高专院校校园体育舞蹈比赛三个团体项目第一名、昭通市2017年党建、党风廉政建设优秀奖、教育目标考核一等奖、市教育系统党建工作示范点、市直教育系统2018年党风廉政建设责任制优秀单位等荣誉。学院教师荣获“禁毒教育先进工作者”、云南省高校思想政治理论课教学比赛、全省德育创新杯教学设计和说课大赛优胜奖等荣誉100余人次；学院沈德刚、和永禄等60余名学生分别获省级“三好学生”、省级优秀学生干部、省第十三届云南省大学生年度人物提名奖、省优秀毕业生等荣誉。马思丹同学代表云南省参加2019年全国职业院校技能大赛中职组护理技能比赛，获全国个人三等奖。
应届初中毕业生，年龄在15-20岁，身体健康，品德优良者均可报名。
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